Молекулярный граф

Материал из m-protect.ru

Перейти к: навигация, поиск

Молекулярный граф — связный неориентированный граф, находящийся во взаимно-однозначном соответствии со структурной формулой химического соединения таким образом, что вершинам графа соответствуют атомы молекулы, а ребрам графа – химические связи между этими атомами. Понятие «молекулярный граф» является базовым для компьютерной химии и хемоинформатики. Как и структурная формула, молекулярный граф является моделью молекулы, и как всякая модель, он отражает далеко не все свойства прототипа. В отличие от структурной формулы, где всегда указывается, к какому химическому элементу относится данный атом, вершины молекулярного графа могут быть непомеченными – в этом случае молекулярный граф будет отражать только структуру, но не состав молекулы. Точно так же ребра молекулярного графа могут быть непомеченными – в таком случае не будет делаться различие между ординарными и кратными химическими связями. В некоторых случаях может использоваться молекулярный граф, отражающий только углеродный скелет молекулы органического соединения. Такой уровень абстрагирования удобен для решения широкого круга химических задач на компьютере.

Естественным расширением молекулярного графа является реакционный граф, ребра которого соответствуют образованию, разрыву и изменению порядка связей между атомами.

Личные инструменты